Estudio destaca una nueva forma de identificar genes de resistencia a antibióticos

Los simios en los zoológicos de los EE. UU. Albergan comunidades bacterianas en sus tractos intestinales que son más similares a los de las personas que comen una dieta no occidental que a la composición intestinal de sus primos de simios salvajes, según un nuevo estudio de la Universidad de Washington en St.
Louis. Además, incluso los simios salvajes que nunca han encontrado antibióticos albergan microbios con genes de resistencia a los antibióticos. Los hallazgos sugieren que el contacto con las personas da forma a las comunidades microbianas intestinales, o microbiomas, de gorilas y chimpancés, y que los microbiomas intestinales de los simios salvajes proporcionan pistas sobre las interacciones entre humanos y simios que podrían informar los esfuerzos para proteger las especies en peligro de extinción. El estudio también destaca una forma de identificar nuevos genes de resistencia a los antibióticos antes de que se establezcan ampliamente en bacterias y personas, dando a los investigadores tiempo para desarrollar herramientas para contrarrestar dichos genes antes de que amenacen la salud humana. El estudio está disponible en línea en The ISME Journal. El microbioma intestinal nos proporciona vitaminas, ayuda a digerir los alimentos, regula la inflamación y mantiene controlados los microbios que causan enfermedades.
Los antibióticos pueden cambiar la composición del microbioma intestinal de manera duradera. "Es difícil determinar exactamente cómo los antibióticos afectan el microbioma intestinal humano cuando casi todos nacen con insectos que ya tienen genes de resistencia a los antibióticos", dijo el autor principal Gautam Dantas, PhD, profesor de patología e inmunología, de microbiología molecular y de ingeniería biomédica en la Facultad de Medicina de la Universidad de Washington. "Los simios salvajes son lo más parecido que tenemos a los pre-antibióticos humanos.
Afortunadamente, tuvimos la oportunidad de trabajar con dos primatólogos muy respetados". Los coautores Crickette Sanz, PhD, profesor asociado de antropología biológica en Artes y Ciencias de la Universidad de Washington, y David Morgan, PhD, investigador en el Centro Lester E. Fisher para el Estudio y Conservación de los Simios en el Zoológico Lincoln Park en Chicago y un investigador científico honorario de la Universidad de Washington estudian chimpancés salvajes y gorilas en un área remota del Parque Nacional Nouabalé-Ndoki en la República del Congo.
El parque es administrado por la Wildlife Conservation Society y el gobierno congoleño. Para conocer los microbiomas intestinales de los simios, Sanz, Morgan y sus equipos de campo siguieron a los simios en grupos conocidos y recogieron discretamente muestras fecales de 18 chimpancés salvajes y 28 gorilas salvajes. El método de muestreo no invasivo permitió a los investigadores recopilar datos sobre los simios sin molestarlos.
Las muestras se almacenaron en nitrógeno líquido, se llevaron a la sede del parque y se transportaron en canoa por el río Sangha y luego en camión a Brazzaville, la capital de la República del Congo, donde se guardaron en un congelador hasta que pudieron enviarse. al laboratorio de Dantas. Los investigadores también recolectaron y enviaron muestras fecales de 81 personas que vivían en las afueras del parque. Mientras tanto, Dantas y su primer autor, Tayte Campbell, PhD, luego un estudiante graduado en el laboratorio de Dantas, hicieron arreglos para obtener muestras fecales de 18 chimpancés y 15 gorilas que viven en el zoológico de Saint Louis o en el zoológico de Lincoln Park.
Los investigadores identificaron los tipos de bacterias y los genes antibióticos presentes en las muestras de gorilas, chimpancés y humanos, y compararon los resultados con datos disponibles públicamente sobre personas que viven en los EE. UU., Perú, El Salvador, Malawi, Tanzania o Venezuela y siguen cazadores-recolectores, agricultores rurales o estilos de vida urbanos.
Los microbiomas intestinales de las personas cuyos datos se incluyeron en el estudio se dividieron en dos grupos. En uno estaban los cazadores-recolectores y los agricultores rurales que típicamente comen una dieta rica en vegetales y ligera en carne y grasa; este grupo incluía a personas de las afueras del parque nacional en la República del Congo. En el segundo grupo había personas urbanas que consumían una dieta occidental rica en carne.
Los gorilas y chimpancés salvajes formaron un tercer grupo distinto de ambos grupos humanos. Pero los simios cautivos cayeron en el primer grupo; eran más parecidos a las personas que comían dietas no occidentales. "Los chimpancés están en peligro de extinción, y los gorilas de las tierras bajas occidentales están en peligro crítico; sus principales amenazas son la destrucción del hábitat, la caza furtiva y las enfermedades", dijo Sanz. puede identificar áreas de preocupación y desarrollar estrategias efectivas de mitigación basadas en evidencia ". Los investigadores también identificaron varios genes de resistencia a antibióticos previamente desconocidos en los simios salvajes y las personas de la República del Congo, incluido uno que confiere resistencia a la colistina, un antibiótico de último recurso. Por ahora, los genes residen en bacterias inofensivas para los humanos.
Pero las bacterias tienen la capacidad de compartir genes, por lo que cualquier gen de resistencia a los antibióticos podría llegar a una especie de bacteria más peligrosa. "Las oportunidades de muestreo raras de los simios salvajes como en este estudio nos dan una mirada hacia el futuro", dijo Campbell. "Cuando encontramos estos nuevos genes de resistencia a los antibióticos en el medio ambiente, podemos estudiarlos y posiblemente encontrar formas de inhibirlos antes de que aparezcan en patógenos humanos y hagan que las infecciones sean muy difíciles de tratar". "Sería muy interesante ampliar esta investigación en una gama más amplia de contextos de conservación, como zonas de tala comercial y operaciones turísticas", agregó Morgan. "Con la llegada de las actividades humanas y las perturbaciones antropogénicas asociadas, los simios salvajes pueden estar expuestos a genes de resistencia a los antibióticos. No sabemos mucho sobre cómo la resistencia a los antibióticos se propaga a través de los entornos naturales, por lo que podría tener implicaciones para la salud pública humana que no tenemos". aún entiendo.
Eso es algo que nos gustaría investigar ".