La mutación N501Y puede estar asociada con una carga viral más alta, dice un estudio preliminar

La aparición de nuevas variantes del coronavirus 2 (SARS-CoV-2) del síndrome respiratorio agudo severo ha sido motivo de gran preocupación para las autoridades de salud pública y los gobiernos involucrados en detener la pandemia en curso de la enfermedad por coronavirus (COVID-19). Un nuevo artículo de investigación de preimpresión publicado en el servidor medRxiv * trata los resultados preliminares de un estudio sobre la denominada variante británica, UI-202012/01, también conocida como linaje B.1.
1.7 o 20B / 501Y. V1.
Estudio: Análisis inicial de un vínculo potencial entre la carga viral y la mutación N501Y en la proteína de pico SARS-COV-2. Crédito de la imagen: Design_Cells / Shutterstock Estudio: Análisis inicial de un posible vínculo entre la carga viral y la mutación N501Y en la proteína de pico SARS-COV-2. Haber de imagen: Design_Cells / Shutterstock Esta variante se documentó por primera vez el 14 de diciembre de 2021 y se define por la mutación N501Y en el dominio de unión al receptor (RBD) de la proteína espiga, la deleción ΔH69 / V70 y muchas otras mutaciones.
Recientemente ha sido informó de que esta variante está aumentando en frecuencia en el sudeste de Inglaterra tan rápido que levanta la sospecha de que ha aumentado la transmisibilidad. El presente estudio tuvo como objetivo investigar este aspecto del virus en términos de aumento de la carga viral. Los investigadores secuenciaron todas las muestras positivas de cuatro laboratorios Lighthouse en el Reino Unido, utilizando su método de secuenciación cuantitativa.
Esto produce el número de lecturas mapeadas únicas, que tiene una correlación con la carga viral y, por lo tanto, actúa como proxy de la misma. Descubrieron que el logaritmo de las lecturas mapeadas únicas se correlacionó negativamente con los valores de Ct obtenidos de la prueba de reacción en cadena de la polimerasa (PCR). Seleccionaron la presencia de Y501 como marcador de la nueva variante.
De 88 muestras que mostraron esta mutación, consideraron solo las muestras tomadas en el período del 31 de octubre al 13 de noviembre de 2020. Esto mostró que el número de únicos las lecturas mapeadas en la variante Y501 fueron más significativas que en la variante N501, lo que indica que la mediana de las cargas virales aumenta aproximadamente tres veces para la variante Y501. Una fuerte correlación negativa entre el valor de Ct y log10 (número de lecturas mapeadas).
El número de lecturas mapeadas de forma única por muestra se puede utilizar como un proxy de la carga viral. El valor Ct que se muestra es el valor Ct máximo obtenido de Majora (la base de datos del COG) de datos retrospectivos para todos los laboratorios Lighthouse que suministran datos Ct; log10 de lecturas mapeadas de forma única (deduplicadas) obtenidas con la plataforma veSEQ se correlaciona bien con Ct. Esto no incluye muestras en este informe ya que los valores Ct aún no estaban disponibles.
Luego, los investigadores examinaron la ubicación geográfica de la que se tomaron diferentes muestras, donde tal información estaba disponible. Descubrieron que cualquiera que fuera la variante presente, todas las muestras del Gran Londres tenían una carga viral mucho más alta en comparación con cualquier otro lugar. En otras ubicaciones, sin embargo, las cargas virales para Y501 fueron mucho más altas en comparación con N501. Sin embargo, es significativo que la ubicación, que se enriqueció para Y501, condado de Kent, no mostró ninguna diferencia entre Y501 y N501 con respecto a cargas. Esto podría indicar que la infección por VUI-202012/01 y la carga viral estaban correlacionadas fuera del Gran Londres. En esta última ubicación, las razones de la falta de asociación podrían deberse a que el estudio no tuvo el poder estadístico suficiente o, alternativamente, podría deberse a diferencias en los parámetros demográficos y epidemiológicos de la población de Londres en relación con otras ubicaciones.
Mayor número de lecturas mapeadas en muestras que exhiben la variante Y501 Box y diagramas de dispersión de lecturas mapeadas únicas, estratificadas por (a) fecha de lote y (b) laboratorio Lighthouse anónimo. No hay una diferencia significativa entre los lotes o los laboratorios Lighthouse para las muestras N501 (p> 0,1 para todas las comparaciones por pares).
Los puntos dentro de cada lote se alteran para ayudar a la visualización. Las líneas horizontales en diagramas de caja representan la mediana y el rango intercuartílico. Los investigadores señalan que las muestras de este estudio provinieron de personas sintomáticas.
Se cree que las cargas virales son más altas al inicio de los síntomas. Dado que los datos secuenciados cubrieron una amplia gama de cargas virales, sugieren que los datos de la prueba provienen de personas en todas las etapas de la infección sintomática. La nueva variante puede estar circulando en un grupo de edad en particular, por ejemplo, que tiene cargas virales más altas.
Esta puede ser una explicación de la diferencia en las correlaciones de carga viral Ct en el Gran Londres versus fuera de esta región. Otro factor es la intensa transmisión que ocurre durante la fase inicial de una epidemia causada por un linaje determinado.
La dispersión del linaje ocurre mucho más tarde. Esto solo se puede confirmar con más investigación. Las razones del crecimiento más rápido asociado con esta variante no están claras: podría deberse a un crecimiento epidémico más rápido, patrones demográficos, efectos fundador o cargas virales más altas, entre otros mecanismos biológicos.
La correlación con cargas virales más altas, en este caso, parece sugerir una mayor transmisibilidad de este virus, pero se requieren más estudios. Nuevamente, la mutación N501Y puede no ser la única razón de esta expansión. Es más necesario comprender cómo se relacionan los niveles virales con la virulencia, ya que esto puede determinar la gravedad de la infección.
medRxiv publica informes científicos preliminares que no son revisados ​​por pares y, por lo tanto, no deben considerarse concluyentes, guiar la práctica clínica / comportamiento relacionado con la salud o tratarse como información establecida.