Un estudio encuentra que Omicron BA.2 es responsable de más, pero menos, infecciones avanzadas infecciosas

En un estudio reciente publicado en el servidor de preimpresión medRxiv *, los investigadores evaluaron la gravedad de las infecciones por coronavirus 2 del síndrome respiratorio agudo severo (SARS-CoV-2) Omicron (B.1.1.
529) entre el 23 de diciembre de 2021, y el 20 de febrero de 2022 en Qatar para comprender cómo las subvariantes de Omicron, la vacunación y el estado de infección previa afectaron estos casos. Estudio: Efectos de la subvariante BA.1/BA.
2, la vacunación y la infección previa sobre la infecciosidad de las infecciones por SARS-CoV-2 Omicron. Haber de imagen: Kuki Ladron de Guevara/Shutterstock Qatar tiene una demografía excepcionalmente joven y diversa, donde solo el 9% de sus residentes tienen más de 50 años y el 89% son expatriados de más de 150 países. Desafortunadamente, a partir del 19 de diciembre de 2021, Catar experimentó un resurgimiento de casos de enfermedad por coronavirus 2019 (COVID-19) debido a Omicron que alcanzó su punto máximo a mediados de enero de 2022.
Durante este tiempo, inicialmente, se informaron más casos debido a Omicron subvariante BA.1, pero a los pocos días, la otra subvariante BA.2 se volvió dominante.
Durante la ola pandémica de Omicron, las pruebas cuantitativas de reacción en cadena de la polimerasa con transcripción inversa (RT-qPCR), realizadas a gran escala en Qatar, ayudaron a diagnosticar el 75 % de las infecciones por COVID-19. Cada prueba de RT-qPCR registró el motivo de la prueba, como el rastreo de contactos, las campañas de pruebas aleatorias, los síntomas clínicos, las solicitudes individuales, las pruebas de atención médica de rutina, antes del viaje, en el puerto de entrada u otros. Casi todos los residentes de Qatar estaban completamente vacunados contra el COVID-19 durante este tiempo, y el gobierno de Qatar tenía toda la información relacionada con el COVID-19 registrada en su sistema de salud.
Las bases de datos federadas de SARS-CoV-2 de Qatar incluso tenían información sobre vacunas realizadas en otro lugar en el puerto de entrada a su llegada a Qatar. En el estudio transversal actual, los investigadores utilizaron el valor del umbral del ciclo (Ct) de RT-qPCR en tiempo real como un indicador de la infecciosidad del SARS-CoV-2 para investigar los efectos de las infecciones de Omicron en todos los residentes de Qatar que tenían un RT. -Infección por SARS-CoV-2 confirmada por qPCR durante el 23 de diciembre de 2021 y el 20 de febrero de 2022. Los investigadores obtuvieron todos los datos demográficos de las bases de datos nacionales de COVID-19 de Qatar, incluidas las infecciones clínicas notificadas, las vacunas, las pruebas de RT-qPCR y los detalles demográficos relacionados desde el comienzo de la pandemia.
Utilizaron el kit combinado TaqPath COVID-19 para el estado de subvariante: una infección por SARS-CoV-2 con la subvariante Omicron BA.1 se representó como un caso de falla del objetivo del gen de pico (S) (SGTF) y con BA.2 la subvariante se representó como un caso que no pertenece al SGTF.
Para cada participante del estudio, los investigadores seleccionaron la primera prueba positiva confirmada por RT-qPCR. Más tarde, derivaron el valor promedio de Ct (que se utilizará como variable dependiente) promediando los valores de Ct de la nucleocápside (N), el marco de lectura abierto 1ab (ORF1ab) y los genes S. En general, investigaron el alcance de la propagación de COVID-19 durante el período de estudio en función de la información de la subvariante que causa la infección (BA.
1 versus BA.2), tipo de vacunación (BNT162b2 o mRNA-1273), estado de vacunación ( dosis, tiempo transcurrido desde la vacunación), estado de infección anterior, motivo de la prueba de RT-qPCR, semana del período de estudio de la prueba y factores demográficos, incluidos el sexo, la edad y la nacionalidad. Utilizaron análisis de regresión lineal univariable para evaluar la asociación de cada uno de estos factores con el valor Ct.
Los análisis de regresión lineal multivariable que representan todas las covariables estimaron intervalos de confianza (IC) del 95 % asociados y valores p. Los investigadores calcularon las diferencias entre las infecciones BA.1 y BA.
2 utilizando las diferencias de medias estandarizadas (DME). Los análisis del estudio cubrieron a 156.202 personas infectadas con Omicron. Al considerar los valores de Ct como una medida de la infecciosidad del SARS-CoV-2, los autores observaron que con 3.
53 ciclos menos, la subvariante BA.2 parecía sustancialmente más infecciosa que la subvariante BA.1.
Proporción de infecciones Omicron BA.1 (frente a BA.2) en las pruebas PCR positivas evaluadas con el TaqPath COVID-19 Combo Kit durante el período de estudio.
Los valores de Ct disminuyeron a medida que transcurría el tiempo desde que aumentaba la vacunación, una tendencia observada tanto para la segunda como para la tercera dosis de vacunación, lo que refleja una disminución de la eficacia de la vacuna con el tiempo. Los valores de Ct fueron 0,86 ciclos más altos para aquellos que recibieron dosis de refuerzo durante los meses previos a la prueba RT-qPCR que para las personas no vacunadas.
De manera similar, los valores de Ct 1,30 ciclos más altos entre aquellos con antecedentes de infección por SARS-CoV-2 en comparación a aquellos sin infección previa significó una menor infecciosidad de la variante Omicron. La disminución de los valores de C t (con la edad) reflejó la disminución de la capacidad para eliminar el SARS-CoV-2 con la edad.
Aunque hubo diferencias en el valor de C t basadas en el sexo y la nacionalidad, probablemente reflejaron comportamientos de búsqueda de pruebas de la población diversa de Qatar, con diferente estatus socioeconómico, y casos con infecciones no documentadas. Los autores observaron los valores de C t más bajos entre las personas que buscan la prueba RT-PCR debido a los síntomas de COVID-19 y los más altos entre aquellos que realizaron la prueba con fines relacionados con viajes. De manera similar, observaron valores de C t más bajos cuando los casos de COVID-19 aumentaron exponencialmente durante la ola de Omicron de diciembre de 2021 y fueron más altos después de que la ola alcanzó su punto máximo.
Más tarde, los valores de C t disminuyeron, ya que solo una pequeña proporción de COVID-19 las infecciones seguían siendo recientes. En general, el estudio demostró que, en comparación con la subvariante BA.1 de Omicron, la subvariante BA.
2 era más infecciosa. Se diseminó rápidamente en Qatar para causar más infecciones por SARS-CoV-2, como se refleja en una mayor carga viral y una mayor duración de la COVID-19. Sin embargo, al igual que se observó para otras variantes del SARS-CoV-2, la inmunidad natural inducida por infecciones previas y la inmunidad inducida por vacunas dieron como resultado infecciones intercurrentes menos infecciosas debido a Omicron.
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